著者の所属・活動拠点の国は、韓国です。

掲載誌:Industrial Crops and Products

ライセンス: CC BY 対象: 公開論文 確認元: OpenAlex

研究の目的

Perilla frutescens(エゴマやシソの仲間)の栽培品種は、一般に var. frutescens と var. crispa の2つの変種に大きく分けられます。どちらの変種にも雑草型と呼ばれる野生に近い形態があり、遺伝的な多様性が高く、重要な遺伝資源として遺伝子バンクで保存されています。

研究チームは、こうした遺伝資源を育種や研究に有効に活用するため、植物の見た目や測定できる性質と、DNAの違いの両面から特徴を調べました。対象は、韓国のPerilla遺伝資源の3つのタイプを代表する232系統からなるコアコレクションです。コアコレクションとは、多数の保存系統の中から多様性をなるべく保つように選び出した、比較的小規模な系統の集まりを指します。

調べたこと

著者らは、10種類の量的形質、つまり数値で測れる性質について、系統間のばらつきを評価しました。ばらつきの大きさは、観察された全体のばらつきを示す表現型変動係数と、そのうち遺伝的な違いに由来すると推定されるばらつきを示す遺伝子型変動係数で表されています。

あわせて、SSRマーカーを用いたDNA解析を行いました。SSRマーカーは、DNA上で短い配列が繰り返される部分の長さの違いを目印にするもので、系統間の遺伝的な違いを調べるのに使われます。さらに、どのマーカーが特定の形質と統計的に関連しているかを調べるマーカー・形質関連解析も実施しました。

主な結果

抄録によると、10の量的形質の遺伝子型変動係数は6.0%から52.5%、表現型変動係数は6.2%から55.5%の範囲でした。形質によって、系統間のばらつきの大きさにかなりの幅があったことになります。

SSRマーカーの解析では高い遺伝的多様性が示され、1つの遺伝子座あたりの対立遺伝子(DNAの型)の数は平均7.7でした。遺伝子多様度の平均は0.638、マーカーが系統を見分ける能力の目安である多型情報含量の平均は0.588と報告されています。

分子分散分析により、遺伝的なばらつき全体のうち、Perillaのタイプ内での違いが82%を占め、タイプ間の違い(18%)を上回ったことが示されました。つまり、同じタイプに属する系統どうしの間にも大きな遺伝的な違いが見られたということです。

マーカー・形質関連解析では、8つのSSRマーカーが6つの量的形質と有意に関連していることが見いだされました。論文は、そのうちKNUPF11、KNUPF26、KNUPF32の3つのマーカーが1つ以上の形質と関連していたことを特に挙げています。なお、これらは統計的な関連であり、マーカーそのものが形質を決めていることを示すものではありません。

研究が示すこと

この研究は、韓国のPerilla遺伝資源のコアコレクションが、測定できる性質とDNAの両面で多様性に富むことを示しました。著者らは、こうした表現型と遺伝子型の情報を組み合わせることが、今後のPerillaの研究や育種に役立つとまとめています。

原著論文の著者・所属:Hyeon Park(Department of Applied Plant Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; Interdisciplinary Program in Smart Agriculture, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; National Agrobiodiversity Center, National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration, Jeonju 54874, Republic of Korea)、Da Hyeon Lee(Department of Applied Plant Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; Interdisciplinary Program in Smart Agriculture, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea)、Jungeun Cho(Department of Applied Plant Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; Interdisciplinary Program in Smart Agriculture, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea)、Tae Hyeon Heo(Department of Applied Plant Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; Interdisciplinary Program in Smart Agriculture, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea)、Kyu Jin Sa(Department of Crop Science, College of Ecology & Environmental Sciences, Kyungpook National University, Sangju 37224, Republic of Korea)、Ju Kyong Lee(Department of Applied Plant Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea; Interdisciplinary Program in Smart Agriculture, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea)

※本記事は原著論文をもとに、日本語で要約・説明を加えた研究紹介です。 出典(原著論文):Hyeon Park, Da Hyeon Lee, Jungeun Cho, et al. Genetic variation and trait–marker associations in a core collection of Perilla frutescens L. revealed by phenotypic traits and SSR markers. Industrial Crops and Products 2026-08-20. DOI: 10.1016/j.indcrop.2026.124209. 原著ライセンス:CC BY.