著者の所属・活動拠点の国は、香港、中国です。

掲載誌：Emerging Microbes & Infections

ライセンス: CC BY　対象: 公開論文　確認元: OpenAlex

研究の目的

香港では、腸チフス以外のサルモネラ菌（非チフス性サルモネラ）が食中毒の主な原因になっています。研究チームによると、よく知られたESBL産生菌やカルバペネマーゼ産生菌に加え、複数の抗菌薬が効かない重い感染症の治療に使われるコリスチンへの耐性も大きな懸念です。日常的な監視体制はあるものの、互いにつながる複数の場で薬剤耐性がどう分布し、ゲノムの面でどう広がっているかは十分に分かっていませんでした。そこで研究チームは、人・動物・環境の健康を一体として捉える「ワンヘルス」の考え方に立ち、異なる分野の菌どうしの遺伝的な近さと、共通する耐性遺伝子を調べることを目的としました。

何を、どのように調べたか

研究チームは、香港の患者から得られたサルモネラ菌と、小売の食肉から得られたサルモネラ菌を解析し、これらを人・食品・動物・環境の各分野を代表する地域の公開ゲノムデータと合わせて比較しました。系統ゲノム解析では合計1,458件のサルモネラゲノムを比べ、どの菌どうしが遺伝的に近いかを調べています。また、長いDNAを読み取れるナノポア・シーケンシングで、耐性遺伝子を運ぶプラスミド（細菌の染色体とは別の小さなDNAで、ほかの菌へ移ることがある）の構造を詳しく調べ、そのプラスミドが試験管内でほかの腸内細菌の仲間へ移るかどうかも確かめました。

主な報告結果

研究チームは、香港の患者から得られたネズミチフス菌（S. Typhimurium）のST34系統の菌から、コリスチン耐性に関わるmcr遺伝子（mcr-1.1とmcr-3.1）を検出したと報告しています。これらは、研究チームの地域データセットや地元のゲノム監視の記録ではそれまで見つかっていなかったものです。mcr-3は、IncC型とIncFII型の特徴が混ざったモザイク状のプラスミドに載っており、その構造は、患者由来のサルモネラと鶏由来の大腸菌のプラスミドに共通する遺伝要素が組み合わさってできたことと矛盾しない特徴を示しました。このプラスミドは試験管内で、肺炎桿菌、シトロバクター属、エンテロバクター属など多様な腸内細菌の仲間へ高い効率で移りました。さらに、豚肉由来の菌から、カルバペネム系抗菌薬を分解する酵素の遺伝子blaNDM-5を運び、ほかの菌へ移りうるプラスミドが見つかりました。地元の株と地域の公開ゲノムを合わせた1,458件の比較では、主要な型（ST19、ST34、ST155、ST40、ST17、ST2529）で、異なる分野に由来するゲノムが混ざった遺伝的なまとまりが確認されました。

この報告が示すこと

研究チームは、地元の臨床株・食肉株と地域の公開ゲノムを合わせた比較から、サルモネラのゲノムが複数のワンヘルス分野にまたがって近縁であることがうかがえるとしています。そのうえで、多剤耐性サルモネラの系統を見守るには、分野ごとに分けるのではなく、各分野を統合したワンヘルス型のゲノム監視が役立つと結論づけています。なお、今回の資料は抄録のみで、研究の限界についての記載はありません。

※出版社の利用条件により本文を利用できないため、本記事は原著論文の抄録だけで作成しています。

原著論文の著者・所属：Tsz Tuen Li（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Wing Ho Li（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Wai-Man Tong（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Ruheng Chen（Department of Microbiology, School of Clinical Medicine, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Jordan Yik Hei Fong（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Hwei Huih Lee（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Elaine Chan（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Ka Fai Chan（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Tengbo Zhang（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Chenlu Xiao（Department of Clinical Microbiology, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine）、Brandon Chi-Cheong Chan（Department of Microbiology, Queen Mary Hospital, Hong Kong Special Administrative Region）、Kelvin Hei-Yeung Chiu（Department of Microbiology, Queen Mary Hospital, Hong Kong Special Administrative Region）、Vincent Chi-Chung Cheng（Department of Microbiology, Queen Mary Hospital, Hong Kong Special Administrative Region）、Hanjun Zhao（Shanghai Institute of Infectious Disease and Biosecurity, Shanghai Medical College, Fudan University）、Kwok Yung Yuen（Carol Yu Centre for Infection, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region; Centre for Virology, Vaccinology and Therapeutics, Hong Kong Science and Technology Park, Hong Kong Special Administrative Region; Department of Microbiology, School of Clinical Medicine, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Man Lung Yeung（Carol Yu Centre for Infection, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region; Centre for Virology, Vaccinology and Therapeutics, Hong Kong Science and Technology Park, Hong Kong Special Administrative Region; Department of Microbiology, School of Clinical Medicine, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region; State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）、Jade Lee Lee Teng（Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region; School of Biomedical Engineering, The University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region）

※本記事は原著論文をもとに、日本語で要約・説明を加えた研究紹介です。 出典（原著論文）：Tsz Tuen Li, Wing Ho Li, Wai-Man Tong, et al. One Health phylogenomics of antibiotic-resistant Salmonella enterica reveals cross-source relatedness and detection of mcr-3 -carrying ST34 isolates in Hong Kong. Emerging Microbes & Infections（出版社：Taylor & Francis） 2026-11-10. DOI: 10.1080/22221751.2026.2761740. 原著ライセンス：CC BY.