著者の所属・活動拠点の国は、フランス、イギリス、アメリカ、アイルランドです。
掲載誌:Journal of Phycology
ライセンス: CC BY 対象: 公開論文 確認元: OpenAlex
研究の目的
研究チームは、コンブ類の一種Saccharina latissimaについて、葉の大きさや窒素代謝に関わる性質と、遺伝的な違いとの関係を調べました。この種は持続可能な養殖の候補として期待されていますが、養殖上重要な性質の遺伝的な仕組みへの理解が限られ、品種改良の妨げになっていることが研究の背景にあります。
何を、どのように調べたか
研究チームは、欧州北部と南部の遺伝的な集団を含む13集団から採集し、そのうち12集団に由来する、自家受精で得た202個体を調べました。共通の環境で育て、葉の長さ・幅・面積と茎の長さの4項目、および窒素代謝に関わる6項目を測定しました。さらに、DNA配列の違いを目印として、各性質との関連をゲノム全体から探す解析を行い、多数の遺伝的な目印から性質を予測するモデルの性能も検証しました。
主な報告結果
研究チームは、遺伝的な目印と性質との間に、統計的に有意な関連を18件見いだしました。関連する個々の遺伝子座が説明したのは、測定した性質の個体差の1.37~10.93%で、特に大きな効果を持つものではなく、小~中程度の寄与でした。最大の寄与は窒素代謝に関わる性質で見られ、17番染色体の1か所は葉の長さと面積の両方に関連していました。遺伝的な目印から推定した遺伝率は、形に関する性質で0.75~0.99、代謝に関する性質で0~0.99でした。また、データを分けて予測を検証したところ、予測値と実測値の対応の強さを示す予測能力は0.21~0.59でした。ただし、タンパク質含有量では、遺伝率も予測能力も実質的にゼロでした。
この報告が示すこと
著者らは、調べた性質には、中程度の効果を持つ遺伝子座と、多数の遺伝子座が関わる仕組みが混在していると結論づけています。そのため、特定の遺伝的な目印を使って個体を選ぶ方法と、ゲノム全体の情報から個体を選ぶ方法を、性質に応じて活用する育種の基盤になると位置づけています。ただし、遺伝率の推定には全般に大きな誤差があり、推定値には不確かさが伴います。
※出版社の利用条件により本文を利用できないため、本記事は原著論文の抄録だけで作成しています。
原著論文の著者・所属:Stéphane Mauger(LIttoral ENvironnement et Sociétés, UMR 7266, CNRS La Rochelle Université La Rochelle France)、Komlan Avia(INRAE, Université de Strasbourg, UMR SVQV Colmar France)、Lucie Jaugeon(Sorbonne Université, CNRS, Integrative Biology of Marine Models Laboratory, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Paolo Ruggeri(Xelect Ltd St Andrews Scotland UK)、Zofia Nehr(Sorbonne Université, CNRS, Integrative Biology of Marine Models Laboratory, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Ousseini Issaka Salia(Department of Animal Sciences Washington State University (WSU) Pullman Washington USA)、Jérôme Coudret(Dispersal, Speciation, Evolution of Marine Species, DISEEM, UMR 7144, CNRS, Sorbonne Université, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Emilie Gouhier(Dispersal, Speciation, Evolution of Marine Species, DISEEM, UMR 7144, CNRS, Sorbonne Université, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Aurélien Baud(Sorbonne Université, CNRS, Integrative Biology of Marine Models Laboratory, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Stéphane Loisel(Dispersal, Speciation, Evolution of Marine Species, DISEEM, UMR 7144, CNRS, Sorbonne Université, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Antoine Fort(Department of Bioveterinary and Microbial Sciences Technological University of the Shannon: Midlands Athlone Ireland)、Ronan Sulpice(Plant Systems Biology Lab, School of Biological and Chemical Sciences, Ryan Institute University of Galway Galway Ireland)、Christophe Destombe(Dispersal, Speciation, Evolution of Marine Species, DISEEM, UMR 7144, CNRS, Sorbonne Université, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Philippe Potin(Sorbonne Université, CNRS, Integrative Biology of Marine Models Laboratory, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、J. Mark Cock(Sorbonne Université, CNRS, Integrative Biology of Marine Models Laboratory, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)、Myriam Valero(Dispersal, Speciation, Evolution of Marine Species, DISEEM, UMR 7144, CNRS, Sorbonne Université, Station Biologique de Roscoff Roscoff France)
※本記事は原著論文をもとに、日本語で要約・説明を加えた研究紹介です。 出典(原著論文):Stéphane Mauger, Komlan Avia, Lucie Jaugeon, et al. Genome‐wide association study of morphometric and metabolic characteristics in European populations of the sugar kelp Saccharina latissima. Journal of Phycology(出版社:Wiley) 2026-09-26. DOI: 10.1111/jpy.70239. 原著ライセンス:CC BY.